MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p5

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021996	C	6	6	8	13	0 %	0 %	0 %	100 %	529247575
2	NC_021996	TTG	2	6	47	52	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529247575
3	NC_021996	TAT	2	6	73	78	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529247575
4	NC_021996	ATG	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529247575
5	NC_021996	TAA	2	6	162	167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529247575
6	NC_021996	GTT	2	6	177	182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529247575
7	NC_021996	TTGC	2	8	347	354	0 %	50 %	25 %	25 %	529247575
8	NC_021996	TGA	2	6	372	377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529247575
9	NC_021996	TTA	2	6	380	385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529247575
10	NC_021996	TAA	2	6	498	503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529247575
11	NC_021996	A	6	6	502	507	100 %	0 %	0 %	0 %	529247575
12	NC_021996	AGA	2	6	518	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529247575
13	NC_021996	TGG	2	6	556	561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529247575
14	NC_021996	CTG	2	6	656	661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529247575
15	NC_021996	ATG	2	6	682	687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529247575
16	NC_021996	AAC	2	6	699	704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529247575
17	NC_021996	ATT	2	6	713	718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529247575
18	NC_021996	AAATAT	2	12	742	753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529247575
19	NC_021996	ATG	2	6	782	787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529247575
20	NC_021996	A	7	7	837	843	100 %	0 %	0 %	0 %	529247575
21	NC_021996	AGG	2	6	881	886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529247575
22	NC_021996	TTGG	2	8	929	936	0 %	50 %	50 %	0 %	529235716
23	NC_021996	GTT	2	6	963	968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529235716
24	NC_021996	T	7	7	967	973	0 %	100 %	0 %	0 %	529235716
25	NC_021996	A	7	7	981	987	100 %	0 %	0 %	0 %	529235716
26	NC_021996	ATA	2	6	1036	1041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529235716
27	NC_021996	ATT	2	6	1056	1061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529235716
28	NC_021996	AT	3	6	1082	1087	50 %	50 %	0 %	0 %	529235716
29	NC_021996	AGT	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529235716
30	NC_021996	A	6	6	1149	1154	100 %	0 %	0 %	0 %	529235717
31	NC_021996	TGA	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529235717
32	NC_021996	TGG	2	6	1199	1204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529235717
33	NC_021996	AAGAG	2	10	1245	1254	60 %	0 %	40 %	0 %	529235717
34	NC_021996	GAATT	2	10	1265	1274	40 %	40 %	20 %	0 %	529235717
35	NC_021996	ATT	2	6	1295	1300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529235717
36	NC_021996	GA	3	6	1339	1344	50 %	0 %	50 %	0 %	529235717
37	NC_021996	ATG	2	6	1345	1350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529235717
38	NC_021996	CAAT	2	8	1367	1374	50 %	25 %	0 %	25 %	529235717
39	NC_021996	TTC	2	6	1389	1394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529235717
40	NC_021996	AGA	2	6	1437	1442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529235717
41	NC_021996	TTATG	2	10	1479	1488	20 %	60 %	20 %	0 %	529235717
42	NC_021996	TTAT	2	8	1508	1515	25 %	75 %	0 %	0 %	529235717
43	NC_021996	AAAT	2	8	1518	1525	75 %	25 %	0 %	0 %	529235717
44	NC_021996	AAG	2	6	1580	1585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529235718
45	NC_021996	A	6	6	1594	1599	100 %	0 %	0 %	0 %	529235718
46	NC_021996	A	6	6	1624	1629	100 %	0 %	0 %	0 %	529235718
47	NC_021996	GATT	2	8	1631	1638	25 %	50 %	25 %	0 %	529235718
48	NC_021996	TGA	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529235718
49	NC_021996	GGT	2	6	1712	1717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529235718
50	NC_021996	TGA	2	6	1776	1781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529235718
51	NC_021996	A	6	6	1849	1854	100 %	0 %	0 %	0 %	529235718
52	NC_021996	TGAG	2	8	1861	1868	25 %	25 %	50 %	0 %	529235718
53	NC_021996	A	6	6	2152	2157	100 %	0 %	0 %	0 %	529235719
54	NC_021996	GAA	2	6	2163	2168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529235719
55	NC_021996	ATA	2	6	2183	2188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529235719
56	NC_021996	ATTT	2	8	2263	2270	25 %	75 %	0 %	0 %	529235719
57	NC_021996	A	6	6	2342	2347	100 %	0 %	0 %	0 %	529235719
58	NC_021996	GAT	2	6	2443	2448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529235719
59	NC_021996	TTC	2	6	2472	2477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529235719
60	NC_021996	ACA	2	6	2493	2498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529235719
61	NC_021996	AG	3	6	2559	2564	50 %	0 %	50 %	0 %	529235719
62	NC_021996	AGC	2	6	2675	2680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529235719
63	NC_021996	TAA	2	6	2688	2693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529235719
64	NC_021996	CAA	2	6	2704	2709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529235719
65	NC_021996	AAT	2	6	2749	2754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529235719
66	NC_021996	AAG	2	6	2765	2770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529235719
67	NC_021996	AATG	2	8	2790	2797	50 %	25 %	25 %	0 %	529235719
68	NC_021996	CAA	2	6	2829	2834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529235719
69	NC_021996	A	7	7	2954	2960	100 %	0 %	0 %	0 %	529235719
70	NC_021996	TGG	2	6	2978	2983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529235719
71	NC_021996	GAA	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529235719
72	NC_021996	A	6	6	3013	3018	100 %	0 %	0 %	0 %	529235719
73	NC_021996	GCTG	2	8	3042	3049	0 %	25 %	50 %	25 %	529235719
74	NC_021996	A	6	6	3172	3177	100 %	0 %	0 %	0 %	529235719
75	NC_021996	GAAT	2	8	3192	3199	50 %	25 %	25 %	0 %	529235719
76	NC_021996	T	6	6	3270	3275	0 %	100 %	0 %	0 %	529235719
77	NC_021996	CAA	2	6	3283	3288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529235719
78	NC_021996	GTT	2	6	3307	3312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529235719
79	NC_021996	GAAG	2	8	3330	3337	50 %	0 %	50 %	0 %	529235719
80	NC_021996	CGG	2	6	3355	3360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529235719
81	NC_021996	ATCA	2	8	3390	3397	50 %	25 %	0 %	25 %	529235719
82	NC_021996	CAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529235719

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.